ZOOM Lite

वर्णन

ZOOM लाइट एक अर्को पुस्ता अनुक्रमण डेटा म्यापि and र दृश्य सफ्टवेयर हो। प्रयोगकर्ताहरू इनपुट सन्दर्भ जीनोमहरू र इलुमिमिना/सोलेक्सा छोटो पढ्ने फाईलहरू वा एबी SOLiD रंग ठाउँले फाईलहरू विभिन्न ढाँचाहरूमा पढ्दछ, जस्तै * .faस्ट्या, * .फास्टक, * _seq.txt, * .csfasta आदि। ZOOM यी छोटोको म्यापि results परिणामहरू आउटपुट गर्दछ। सन्दर्भ अनुक्रम मा पढ्छ। ZOOM लाइटको द्रुत र सटीक म्यापि ker कर्नेल नयाँ डिजाइन गरिएको बहु अन्तरिक्ष बीज सिद्धान्तमा आधारित छ। दुबै एकल-अन्त र जोडी-अन्त पढी विभिन्न लम्बाईहरूको १bbp देखि २0०bp बाट ह्यान्डल गर्न सकिन्छ। सन्दर्भ अनुक्रममा पठन र यसको लक्षित क्षेत्र बिचको बेमेलको कुनै पनि बेमेल र एक सम्मिलित/मेटाउने अनुमति छ। अद्वितीय रूपमा नक्सा गरिएको परिणामहरू वा सबै पढ्नका लागि उत्तम (शीर्ष एन) परिणामहरू न्यूनतम बेमेल र ईन्डेल लम्बाइका आधारमा रिपोर्ट गरिनेछ। गुणवत्ता स्कोर म्यापिpping सटीकता बढाउन प्रयोग गरीन्छ। म्यापि ker कर्नेलको आधारमा, ZOOM लाइटले प्रयोगकर्ताहरूलाई स्थानीय पठन डाटा र सन्दर्भ अनुक्रम डाटा लोड गर्न, उचित प्यारामिटरहरू चयन गर्न, चारवटा CPU बीचमा समानान्तर उच्च भोल्युम डाटा प्रशोधन गर्न, चलिरहेका कार्यहरूको अनुगमन गर्न, म्यापि results परिणामहरू भण्डारण गर्न, ग्राफहरूको अवलोकन गर्न अनुमति दिन्छ। म्यापि results परिणामहरू र आउटपुट म्यापि results परिणामहरू या त * * BED वा * .GFF फाईल ढाँचामा UCSC ब्राउजर ट्र्याक जानकारीको साथ सर्वेक्षण गर्नका लागि। म्यापि results परिणामहरू कुनै पनि वांछित मापनमा हेर्न सकिन्छ, सम्पूर्ण क्रोमोसोममा पढेको गहिराइ ग्राफबाट विस्तृत अनुक्रम प reads्क्ति र सन्दर्भ अनुक्रम बीचमा। प्रयोगकर्ताहरू सजिलै क्लिक र ड्र्याग वा स्क्रोलिंग मार्फत रूचिका क्षेत्रहरूमा नेभिगेट गर्छन्। ZOOM लाइट ZOOM स्टूडियो सफ्टवेयरको व्युत्पन्न हो।