| संस्करण | 4.5 |
|---|---|
| प्रकाशक | Bioinformatics Solutions |
| जारी मिति | २०१० मे १० |
| मिति थपियो | २०१० जुलाई १६ |
| ओएस आवश्यकताहरू | Windows XP/Vista/7 |
| आवश्यकताहरु | None |
| कुल डाउनलोड | ९,४६४ |
| हप्तामा डाउनलोडहरू | ९ |
| मूल्य | Free |
वर्णन
RAPTOR एक नवीन सफ्टवेयर हो जुन सही प्रोटीन संरचना भविष्यवाणीको लागि डिजाइन गरिएको हो। यसले एक एकीकृत सफ्टवेयर समाधानमा उन्नत विश्लेषण उपकरणहरू संयोजन गर्दछ र तीन फरक थ्रेडि methods विधिहरू प्रदान गर्दछ। RAPTOR को अद्वितीय पूर्णांक प्रोग्रामिंग अप्टिमाइजेसन दृष्टिकोण कम अनुक्रम होमोलिजको साथ लक्ष्यहरूको संरचना टेम्प्लेटहरू फेला पार्न सबैभन्दा प्रभावकारी छ र उच्च गुणवत्ताको मोडेलहरू उत्पन्न गर्न सक्षम छ। सजीलो ईन्टरफेस र सजीलो बुझ्न E मानहरू शुरुवातकर्ता र विज्ञहरूको लागि आदर्श हो। सबै भन्दा माथि, आउटपुटको सहज ज्ञानले प्रयोगकर्ताहरूलाई केवल एक नजरमा परिणामहरू बुझ्न सक्षम गर्दछ। लक्षित प्रोटीन अनुक्रम दिईयो, यदि त्यहाँ ज्ञात थ्रीडी संरचनाको साथ एक hologologous प्रोटीन छ भने, यो अनुक्रम खोजी उपकरणहरू जस्तै PSI-BLAST प्रयोग गरेर फेला पार्न सकिन्छ, RAPTOR मा पनि प्रदान गरियो। लक्ष्यको संरचना त्यसपछि ज्ञात संरचनाबाट निर्माण गरिन्छ; जहाँसम्म, जब अनुक्रम homology महत्वपूर्ण छैन, अर्थात् 25% भन्दा कम, PSI-BLAST एक आत्मविश्वास हिटको साथ आउन सक्दैन। PSI-BLAST भन्दा फरक छ, जसले केवल क्रम अनुक्रम खोज, प्रोटीन थ्रेडि,, गुना मान्यता, दुबै होमोलजी र संरचना जानकारी प्रयोग गर्दछ। यसले ज्ञात संरचनाहरूको डाटाबेस बिरूद्ध अज्ञात संरचनाको साथ प्रोटीन अनुक्रम स्क्यान गर्दछ। एक स्कोरिंग समारोह प्रयोग गरेर र त्रि-आयामिक संरचनाहरू र रैखिक प्रोटीन अनुक्रमहरू बीच अनुकूलता विश्लेषण सञ्चालन गरेर, सबै भन्दा राम्रो संरचनात्मक टेम्प्लेट पहिचान हुनेछ जुनबाट क्रमको संरचना निर्माण गर्ने। नतीजाको रूपमा, प्रोटीन थ्रेडिंगले होमोलोजी मोडलि than भन्दा राम्रो भविष्यवाणी दिन्छ जब सीमान्त अनुक्रम होमोलोजी हुन्छ।
