FlexS

वर्णन

FlexS ले अर्कोको सापेक्ष लिगान्डहरू मध्ये एकको रूपान्तरण र अभिमुखीकरणको भविष्यवाणी गर्दछ। FlexS मा सन्दर्भ-लिगान्डलाई कठोर मानिन्छ, यसैले, यो बाउन्ड स्टेटसँग मिल्दोजुल्दो कन्फर्मेसनमा दिइनुपर्छ। FlexS मा सुपरपोजिसन एल्गोरिथ्मलाई थोरै म्यानुअल हस्तक्षेप चाहिन्छ। तपाईले यस ज्ञानलाई म्यानुअल रूपमा एकल चरणहरू पूरा गरेर FlexS सँग गणनामा एकीकृत गर्न सक्नुहुन्छ। तसर्थ, FlexS लाई ligand जोडीहरूमा अन्तरक्रियात्मक कार्यको लागि साथै ligand-आधारित भर्चुअल स्क्रीनिंगको लागि डिजाइन गरिएको हो। FlexS का दुई मुख्य एप्लिकेसनहरू ligand सुपर पोजिशनिङ (जस्तै CoMFA/QSAR को लागि) र भर्चुअल स्क्रीनिङ हुन्। यदि तपाइँसँग एक प्रोटीन छ र यसमा एक सानो अणु बाइन्डिङ छ (तथाकथित सन्दर्भ-लिगान्ड) तर प्रोटीनको कुनै संरचना छैन, तपाइँ सक्रिय साइटको नकारात्मक फिंगरप्रिन्टको रूपमा सन्दर्भ संरचना लिन सक्नुहुन्छ। FlexS ले तिनीहरूलाई पङ्क्तिबद्ध गरेर परीक्षण र सन्दर्भ संरचना बीचको समानता निर्धारण गर्दछ। भर्चुअल स्क्रिनिङमा, तपाईंसँग सन्दर्भ-लिगान्ड र यौगिकहरूको सेट छ र तपाईं प्रयोगात्मक परीक्षणको लागि यौगिकहरूलाई प्राथमिकता दिनमा रुचि राख्नुहुन्छ।